git clone https://github.com/qgeng1465/ai4bio-agents.git
cd ai4bio-agents
python install.py
BioMCP 是一个开源 MCP 服务器,零配置直连 43 个公开生物数据库(PubMed / NCBI / Ensembl / STRING / KEGG / gnomAD / GoDMC / EWAS / GTEx / Open Targets 等),提供 83 个工具覆盖文献检索、序列分析、结构预测、富集分析、变异注释、人群频率、表观遗传、组织表达、药物靶点等全流程。
本仓库的 14 个智能体全部支持 MCP 优先路径:检测到 BioMCP 配置后,优先调用 MCP 工具查询数据库(速度快十倍)。未配置 BioMCP 时,智能体自动降级为直连 API(完全兼容)。
安装 BioMCP:pip install biomcp-server
在 AI 助手的 MCP 配置中添加(Settings → MCP Servers):
{
"mcpServers": {
"bio-mcp": {
"command": "bio-mcp"
}
}
}